В 1808 г. вследствие войны с Наполеоном, потребовавшией напряжения всех сил России, полевые регулярные войска, находившиеся в Сибири, были направлены в европейскую часть России, а охрана Сибирской линии была возложена на сибирских казаков. Отсутствие подвижных регулярных войск привело к организации в 1808 г. Сибирского линейного казачьего войска, которое впервые получило четкую организацию: десять отделов мирного времени, которые в военное время преобразовывались в десять Сибирских линейных казачьих конных полков с первого по десятый номер. Вплоть до распада Российской империи, сибирские казаки являлись основой российских вооруженных сил в Сибири.

14 августа 1809 года 1-й полк Сибирского линейного казачьего войска получил знамя (бунчук). Оно состояло из двух горизонтальных полос тёмно-красного и зелёного цветов. В середине изображался Георгиевский крест с сиянием. Штаб полка находился в станице Пресногорьковской.

Во время Отечественной войны 1812 года полки сибирских казаков, единственная кавалерия в Западной Сибири, надежно охраняли границу России.

C 5 марта 1861 г. полк стал именоваться Сибирский казачий конный № 1 полк. Штаб-квартира 1-го Сибирского казачьего полка перенесена из станицы Пресновская в станицу Кокчетавскую.

12 декабря 1882 года Сибирскому казачьему № 1-му полку Высочайше было пожаловано Шефство атамана Ермака Тимофеева. Высочайшее повеление о наименовании 1 полка Сибирского войска № 1 Сибирским казачьим Ермака Тимофеева полком было получено в Кульдже 15 декабря 1882 года.

24 мая 1894 года было введено новое наименование казачьих полков. Отныне и навсегда полк стал именоваться 1-й Сибирский казачий Ермака Тимофеева полк. [1]

6 декабря 1916 г. Николай II принял шефство над полком и внёс в его списки своего сына Алексея Августейшего Атамана всех Казачьих Войск России. Полк стал именоваться 1 Сибирский казачий Ермака Тимофеева, ныне Его Императорского Величества, полк. Его чины получили право носить на погонах царские вензеля.