Молдавское княжество располагалось на восточных склонах Карпат. Сейчас земли княжества входят в состав современных государств: Молдавия, Украина и Румыния. На востоке территория княжества ограничивалась рекой Днестр, по которой пролегала граница сначала с Золотой Ордой, потом — с Речью Посполитой, Украиной, со временем с Российской империей, простирающаяся от истоков реки вплоть до Днестровского лимана. На юге и юго-востоке княжество непродолжительное время выходило к Чёрному морю, так как эту территорию часто захватывали соседние государства. На юге граница с Валахией, а затем Османской империей, проходила по Килийскому гирлу, что в дельте Дуная, а затем по рекам Дунай, Сирет и Милков (рум.). В районе Карпатских гор граница сворачивала к северу, проходя дальше по вершинам Карпат. Тут Молдавское княжество соседствовало с Трансильванией и Венгрией. С северо-востока Молдавское княжество отделяла от Польского королевства и очаковских татар река Днестр. Реки Днестр, Серафинец, Колачин и Черемош в совокупности образовывали северные границы княжества.